Symétrie moléculaire

En chimie, la symétrie moléculaire décrit la symétrie présente dans les molécules ainsi que la classification de ces molécules en fonctions de leur symétrie. La symétrie moléculaire est un concept fondamental en chimie car elle permet de prévoir ou d'expliquer un grand nombre des propriétés chimiques des molécules telles que les transitions spectroscopiques permises ou encore la présence ou l'absence d'un moment dipolaire. Elle repose sur la théorie des groupes et implique de définir les états des molécules à l'aide de représentations irréductibles des groupes à partir de la table des caractères du groupe de symétrie de la molécule. La symétrie est utile pour étudier les orbitales moléculaires en application de la méthode de Hückel, de la théorie du champ de ligands et des règles de Woodward–Hoffmann. Elle est également utilisée en cristallographie à travers les systèmes cristallins pour décrire les symétries dans les matériaux massifs. La chimie de coordination, l'étude des orbitales moléculaires et la spectroscopie des espèces chimiques utilisent la notation Schoenflies pour décrire à quel groupe ponctuel de symétrie se rattache une molécule ; en cristallographie, on utilise plutôt les symboles de Hermann-Mauguin.

Il existe de nombreuses techniques permettant de déterminer la symétrie d'une molécule donnée, comme la cristallographie aux rayons X et diverses formes de spectroscopie. Les notations spectroscopiques reposent sur des considérations de symétrie.

Opérations de symétrie et éléments de symétrie

Les opérations de symétries peuvent être représentées de plusieurs manières. On peut le faire par exemple à l'aide de matrices dont les colonnes représentent, pour une base donnée, les coordonnées des nouveaux vecteurs obtenus après transformation des vecteurs de la base par l'opération de symétrie. On appelle caractère de la représentation la trace de cette matrice. Les représentations irréductibles du groupe sont souvent utilisées, car toutes les autres représentations du groupe peuvent être décrites comme des sommes directes de représentations irréductibles (théorème de Maschke).

Une opération de symétrie est une transformation géométrique qui échange des atomes équivalents ou laisse les atomes invariants^[1]. Pour chaque groupe ponctuel, une table des caractères résume l'information sur les opérations de symétrie du groupe et ses représentations irréductibles. On peut ainsi établir une liste de tables de caractères utiles en chimie (en). Dans ces tables, chaque ligne correspond à une représentation irréductible (désignée par une étiquette de symétrie), chaque colonne à une opération de symétrie (désignée par sa notation Schoenflies), et les deux dernières colonnes indiquent quels sont les vecteurs usuels, notamment les orbitales atomiques, qui suivent les transformations indiquées par chaque représentation irréductible.

En effet, si toutes les opérations de symétrie du groupe auquel se rattache la molécule laissent celle-ci inchangée, une opération du groupe ne laisse pas forcément inchangé chacun des vecteurs considérés. Les vecteurs que l'on considère sont souvent des orbitales atomiques ou des vecteurs d'espace dont la variation décrit une vibration moléculaire. C'est pourquoi on attache à chacune de ces orbitales ou chacun de ces vecteurs une étiquette de symétrie qui correspond à « sa » représentation irréductible dans le groupe de la molécule, c'est-à-dire à la représentation irréductible du groupe qui décrit les transformations du vecteur considéré. Ainsi, dire que deux orbitales moléculaires sont « de même symétrie » signifie qu'elles ont la même représentation irréductible. Ce vocabulaire est notamment utilisé en spectroscopie où les transitions entre deux niveaux d'énergie seront considérées comme « permises de symétrie » si elles se font entre deux orbitales de même symétrie, au sens indiqué ici.

Il existe cinq familles d'opérations de symétrie qui peuvent laisser la géométrie d'une molécule inchangée : les rotations, les réflexions, les inversions, les rotations impropres et l'élément identité. Chaque opération de symétrie est associée à un élément de symétrie tel qu'un axe, un plan, ou un centre : par exemple, une rotation se fait autour d'un axe de symétrie, et une réflexion se fait par rapport à un plan de symétrie.

Rotations

BF₃ a une géométrie plane trigonale avec un axe de rotation C₃.

Si la rotation d'une molécule par $360° / n$ autour d'un axe donné redonne une molécule identique à la molécule initiale, l'axe en question est dit un axe de rotation d'ordre n, désigné par le symbole C_n. Par exemple, dans le cas du trifluorure de bore BF₃, l'axe perpendiculaire au plan moléculaire est un axe C₃. Cet axe génère trois opérations de rotation : C₃, C₃² et C₃³ = E (l'élément identité, voir plus loin).

Si une molécule possède plus d'un axe de rotation, l'axe d'ordre le plus grand est dit axe principal. Dans le cas du trifluorure de bore, l'axe C₃ est l'axe principal de rotation. Il existe également trois axes C₂ équivalents, un sur chaque liaison B–F, car la rotation par 180⁰ autour d'une liaison passant par un atome de fluor ne fait qu'échanger les deux autres atomes de fluor.

Dans une molécule linéaire comme HCl ou HC≡CH, l'axe moléculaire est un axe d'ordre infini C_∞, parce qu'il existe un nombre infini d'angles de rotation qui redonnent une molécule identique à la molécule initiale.

Éléments de symétrie du formaldéhyde.

σ ν

et

σ ν

^’ sont deux plans de réflexion non équivalents.

Réflexions

La réflexion d'une molécule dans un plan est dite opération de symétrie lorsqu'elle génère une copie identique à la molécule initiale. Dans ce cas le plan de réflexion est l'élément de symétrie dit plan de symétrie ou plan miroir, et désigné par le symbole $σ$ (sigma = « s » grec, du mot allemand Spiegel = « miroir »).

La molécule de formaldéhyde HCHO possède deux plans miroirs dits verticaux (symbole $v$ ) parce qu'ils contiennent l'axe de rotation C₂ de la molécule. Le plan désigné $σ v$ passe entre les deux atomes d'hydrogène, et la réflexion dans ce plan échange les deux atomes d'hydrogène l'un pour l'autre. Le plan désigné $σ v$ ^’ contient les deux atomes d'hydrogène, qui ne sont pas alors déplacés par la réflexion dans ce plan. Si une molécule contient plus d'un axe de rotation, un plan dit vertical contient l'axe principal.

D'autres molécules présentent un plan horizontal ( $σ$ _h) perpendiculaire à l'axe principal. Pour la molécule BF₃, par exemple, le plan de la molécule est $σ$ _h parce qu'il est perpendiculaire à l'axe C₃.

Centre d'inversion

Molécule de SF₆.

Une molécule possède un centre d'inversion (abrégé i ) ou centre de symétrie si pour chaque atome dans la molécule hors le centre même, il existe un autre atome identique directement à travers du centre et à distance égale du centre. En effet, si le centre de symétrie est à l'origine des coordonnées, les atomes identiques se trouvent aux points ( $x$ , $y$ , $z$ ) et (− $x$ , − $y$ , − $z$ ). L'opération d'inversion a pour effet de déplacer chaque atome jusqu'à l'atome identique à l'autre côté du centre.

Le centre même peut être occupé par un atome ou non. Par exemple, l'hexafluorure de soufre SF₆ présente une géométrie octaédrique et son centre d'inversion se trouve au niveau de l'atome de soufre, tandis que le benzène C₆H₆ présente une géométrie plane hexagonale et son centre d'inversion est au centre du cycle où ne se trouve aucun atome.

Rotations impropres

Géométrie de la molécule d'éthane en conformation décalée.

Dans certaines molécules, la combinaison (dite produit) d'une rotation C_n et de la réflexion dans un plan perpendiculaire à cet axe peut être une opération de symétrie, même si la rotation seule ou la réflexion seule ne sont pas des opérations de symétrie. Dans ce cas, l'opération de symétrie est dite rotation-réflexion ou bien rotation impropre (symbole S_n).

À titre d'exemple, la liaison carbone-carbone de l'éthane n'est pas axe de symétrie C₆ bien qu'il soit un axe C₃, et le plan $σ$ _h perpendiculaire à cette liaison en son centre n'est pas non plus un plan de symétrie. Cependant, le produit S₆ = $σ$ _hC₆ (ou bien C₆ $σ$ _h) est bien une opération de symétrie, parce qu'il amène chaque atome dans un atome équivalent. L'axe S₆ génère les opérations S₆, S₆² = C₃, S₆³ = S₂ = i, S₆⁴ = C₃² , S₆⁵ et S₆⁶ = E.

Un axe S₁ correspond à un plan de réflexion (sans rotation), et un axe S₂ correspond à un centre d'inversion. Une molécule tétraédrique telle que le méthane possède trois axes S₄.

Identité

L'élément neutre du groupe, ou élément identité, est noté E, du mot allemand Einheit qui signifie « unité ». Toute molécule possède cet élément, qui ne fait aucun changement à la molécule. Bien que cet élément semble trivial, il convient de l'inclure dans l'ensemble des éléments de symétrie pour former un groupe mathématique, dont la définition exige l'inclusion de l'élément identité. En effet, il est analogue à l'opération mathématique de « multiplier par 1 », qui ne change pas le nombre sur lequel elle agit.

Les groupes de symétrie

Les groupes en mathématiques

Les opérations de symétrie d'une molécule (ou d'un autre objet) forment un groupe. En mathématiques, un groupe est un ensemble pourvu d'une opération binaire qui satisfait les quatre propriétés de groupe ci-dessous. Dans un groupe de symétrie, les éléments du groupe sont les opérations de symétrie (et non les éléments de symétrie), et la combinaison binaire (ou produit) de deux éléments a pour effet d'appliquer successivement une opération de symétrie puis l'autre. Par exemple, la composition d'une rotation C₄ autour de l'axe $z$ suivie d'une réflexion par rapport au plan $xy$ est désignée par $σ$ ( $xy$ ) C₄. Par convention, l'ordre des opérations est représenté de droite à gauche.

Un groupe de symétrie obéit aux quatre propriétés ci-dessous, qui définissent tous les groupes :

Propriété de fermeture. Pour chaque paire d'éléments $x$ et $y$ du groupe G, le produit $x$ $y$ est aussi élément du groupe G. Ceci implique que le groupe est fermé de sorte que combiner deux éléments ne produit aucun nouvel élément. Les opérations de symétrie ont toutes cette propriété parce que la suite de deux opérations doit produire un troisième état impossible à distinguer du deuxième état et donc du premier état, de sorte que l'effet net sur la molécule est toujours une opération de symétrie.
Associativité. Pour chaque $x$ et $y$ et $z$ du groupe G, les deux combinaisons triples ( $x$ $y$ ) $z$ et $x$ ( $y$ $z$ ) donnent un même élément de G. C'est-à-dire ( $x$ $y$ ) $z$ = $x$ ( $y$ $z$ ) pour tout $x$ , $y$ , et $z$ ∈ G.
Existence d'un élément neutre. Tout groupe G doit avoir un élément neutre (ou élément identité) E de sorte que les produits de E avec un élément quelconque $x$ de G laisse l'élément inchangé : $x$ E = E $x$ = $x$ . Pour un groupe de symétrie moléculaire, l'élément neutre a pour effet de laisser tout atome en position inchangée.
Existence d'un inverse de chaque élément. Pour chaque élément $x$ de G, il existe un élément inverse $y$ tel que $x$ $y$ = $y$ $x$ = E. Par exemple, l'inverse d'une rotation dans un sens donné est une rotation de même angle mais de sens opposé.

L'ordre d'un groupe est le nombre d'éléments qu'il contient.

Groupes ponctuels de symétrie

Organigramme pour identifier le groupe ponctuel d'une molécule

L'application consécutive (dite composition) de deux ou plusieurs opérations de symétrie d'une molécule correspond à une seule opération de symétrie. Par exemple, une rotation C₂ suivie d'une réflexion $σ$ _v équivaut à la réflexion $σ$ _v’. Ceci s'écrit $σ$ _v*C₂ = $σ$ _v’, où par convention l'opération qui est effectuée en premier est écrite à droite. L'ensemble de toutes les opérations de symétrie de la molécule (y compris les compositions) obéit à toutes les propriétés d'un groupe.

Ce groupe forme le groupe ponctuel de symétrie de la molécule. Le mot ponctuel implique que l'ensemble des opérations de symétrie laisse au moins un point fixe dans l'espace. Pour certaines opérations, un axe entier ou un plan entier reste fixe. Le groupe ponctuel inclut toutes les opérations qui laissent ce point fixe. En revanche, la symétrie d'un cristal est décrite par un groupe d'espace qui inclut également des opérations de translation dans l'espace.

Exemples des groupes ponctuels de symétrie

L'attribution d'un groupe ponctuel à chaque molécule classe les molécules en catégories avec des propriétés semblables de symétrie. Par exemple, les molécules PCl₃, POF₃, XeO₃, et NH₃ partagent toutes le même ensemble de six opérations de symétrie^[2]. On peut leur appliquer l'élément neutre E, deux rotations C₃ différentes, et trois réflexions $σ$ _v différentes sans changer leurs géométries, de sorte qu'elles ont toutes le même groupe ponctuel d'ordre 6 nommé C_3v^[3].

De même, l'eau H₂O et le sulfure d'hydrogène H₂S partagent également des opérations de symétrie identiques. On peut leur appliquer l'élément neutre E, une rotation C₂ et deux réflexions $σ$ _v et $σ$ _v’. Cet ensemble correspond au groupe ponctuel C_2v d'ordre 4^[4].

L'organigramme ci-contre permet d'identifier le groupe ponctuel de symétrie de la grande majorité de molécules. Ce système de classement aide les scientifiques à étudier les molécules de façon plus efficace, parce que les molécules de nature chimique semblable et de même groupe de symétrie ont généralement des liaisons et des propriétés spectroscopiques semblables^[3].

Tableau de groupes ponctuels

Ce tableau fournit une liste de groupes ponctuels communs nommés selon la notation Schoenflies employés en chimie et en spectroscopie moléculaire. Les structures indiquées incluent les formes communes des molécules, qui peuvent souvent être expliquées par la théorie VSEPR.

Groupe ponctuel	Opérations de symétrie^[5]	Description simple de la géométrie type	Exemple 1	Exemple 2	Exemple 3
C₁	E	aucune symétrie, chirale	Bromochlorofluorométhane (deux énantiomères indiqués)	Acide lysergique	L-Leucine et la plupart des autres acides α-aminés hormis la glycine
C_s	E $σ$ _h	plan miroir, aucune autre symétrie	Chlorure de thionyle, SOCl₂	Acide hypochloreux, HClO	Chloroiodométhane, CH₂ClI
C_i	E i	centre d'inversion	Acide mésotartrique	Acide mucique (acide méso-galactarique)	(S,R) 1,2-Dibromo-1,2-dichloroéthane (conformère anti)
C_∞v	E 2C_∞^$Φ$ ∞ $σ$ _v	linéaire	Fluorure d'hydrogène, HF (et toute autre molécule diatomique hétéronucléaire)	Protoxyde d'azote, N₂O	Cyanure d'hydrogène, HCN
D_∞h	E 2C_∞^$Φ$ ∞ $σ$ _i i 2S_∞^$Φ$ ∞C₂	linéaire avec centre d'inversion	Dioxygène, O₂ (et toute autre molécule diatomique homonucléaire)	Dioxyde de carbone, CO₂	Acétylène, HC≡CH
C₂	E C₂	"géométrie à livre ouvert", chirale	Peroxyde d'hydrogène, H₂O₂	Hydrazine, N₂H₄	Tétrahydrofurane (conformation tordue)
C₃	E C₃	hélice aérienne, chirale	Triphénylphosphine	Triéthylamine	Acide phosphorique
C_2h	E C₂ i $σ$ _h	plane avec centre d'inversion, aucun plan vertical	trans-1,2-Dichloroéthène	trans-Difluorure de diazote	trans-Azobenzène
C_3h	E C₃ C₃² $σ$ _h S₃ S₃⁵	hélice aérienne	Acide borique	Phloroglucinol (1,3,5-trihydroxybenzène)
C_2v	E C₂ $σ$ _v( $xz$ ) $σ$ _v’( $yz$ )	coudée (angulaire) (H₂O) ou balançoire de bascule (SF₄) ou forme en T (ClF₃)	Eau	Tétrafluorure de soufre	Trifluorure de chlore
C_3v	E 2C₃ 3 $σ$ _v	pyramide trigonale	Ammoniac	Trichlorure de phosphoryle, POCl₃	Hydrocarbonyle de cobalt, HCo(CO)₄
C_4v	E 2C₄ C₂ 2 $σ$ _v 2 $σ$ _d	pyramidale à base carrée	Oxytétrafluorure de xénon	Pentaborane(9), B₅H₉	Anion nitroprussiate [Fe(CN)₅(NO)]²⁻
C_5v	E 2C₅ 2C₅² 5 $σ$ _v	tabouret	(η⁵-C₅H₅)Ni(NO)	Corannulène
D₂	E C₂( $x$ ) C₂( $y$ ) C₂( $z$ )	tordue, chirale	Biphényle (conformère gauche)	Twistane (C₁₀H₁₆)	Forme bateau croisée du cyclohexane
D₃	E C₃( $z$ ) 3C₂	hélice triple, chirale	Cation tris(éthylènediamine)cobalt(III)	Anion ferrioxalate
D_2h	E C₂( $z$ ) C₂( $y$ ) C₂( $x$ ) i $σ$ ( $xy$ ) $σ$ ( $xz$ ) $σ$ ( $yz$ )	plane avec centre d'inversion et plans verticaux	Éthylène	Pyrazine	Diborane
D_3h	E 2C₃ 3C₂ $σ$ _h 2S₃ 3 $σ$ _v	plane trigonale	Trifluorure de bore	Pentachlorure de phosphore	Cyclopropane
D_4h	E 2C₄ C₂ 2C₂’ 2C₂’’ i 2S₄ $σ$ _h 2 $σ$ _v 2 $σ$ _d	plane carrée	Tétrafluorure de xénon	Anion octachlorodimolybdate(II)	trans-[Co^III(NH₃)₄Cl₂]⁺ (atomes H exclus)
D_5h	E 2C₅ 2C₅² 5C₂ $σ$ _h 2S₅ 2S₅³ 5 $σ$ _v	pentagonale	Anion cyclopentadiényle, C₅H₅⁻	Ruthénocène	Fullerène C₇₀
D_6h	E 2C₆ 2C₃ C₂ 3C₂’ 3C₂’’ i 2S₃ 2S₆ $σ$ _h 3 $σ$ _d 3 $σ$ _v	hexagonale	Benzène	Bis(benzène)chrome	Coronène, C₂₄H₁₂
D_7h	E C₇ S₇ 7C₂ $σ$ _h 7 $σ$ _v	heptagonale	Ion tropylium, C₇H₇⁺
D_8h	E C₈ C₄ C₂ S₈ i 8C₂ $σ$ _h 4 $σ$ _v 4 $σ$ _d	octagonale	Anion cyclooctatétraénure, C₈H₈²⁻	Uranocène
D_2d	E 2S₄ C₂ 2C₂’ 2 $σ$ _d	tordue à 90°	Allène	Tétranitrure de tétrasoufre	Diborane(4) (état excité)
D_3d	E 2C₃ 3C₂ i 2S₆ 3 $σ$ _d	tordue à 60°	Éthane (conformation décalée)	Octacarbonyle de dicobalt (isomère sans pont)	Cyclohexane en conformation chaise
D_4d	E 2S₈ 2C₄ 2S₈³ C₂ 4C₂’ 4 $σ$ _d	tordue à 45°	Cyclooctasoufre, S₈	Décacarbonyle de dimanganèse (rotamère décalé)	Ion octafluoroxénate (géométrie idéale)
D_5d	E 2C₅ 2C₅² 5C₂ i 2S₁₀³ 2S₁₀ 5 $σ$ _d	tordue à 36°	Ferrocène (rotamère décalé)
S₄	E 2S₄ C₂		1,2,3,4-Tétrafluorospiropentane^[6]
T_d	E 8C₃ 3C₂ 6S₄ 6 $σ$ _d	tétraèdre	Méthane	Pentoxyde de phosphore	Adamantane
O_h	E 8C₃ 6C₂ 6C₄ 3C₂ i 6S₄ 8S₆ 3 $σ$ _h 6 $σ$ _d	octaédrique ou cubique	Hexafluorure de soufre	Hexacarbonyle de molybdène	Cubane
I_h	E 12C₅ 12C₅² 20C₃ 15C₂ i 12S₁₀ 12S₁₀³ 20S₆ 15 $σ$	icosaédrique ou dodécaédrique	Buckminsterfullerène, C₆₀	Anion dodécaborate	Dodécaédrane

Notes et références

↑ Alain Sevin et al., Chimie Générale - tout le cours en fiches, Dunod, 2012, p. 16-17
↑ Brian Pfennig, Principles of Inorganic Chemistry, Wiley, 191 p. (ISBN 978-1-118-85910-0)
↑ ^{a et b} Brian Pfennig, Principles of Inorganic Chemistry, Wiley (ISBN 978-1-118-85910-0)
↑ Gary Miessler, Inorganic Chemistry, Pearson, 2004 (ISBN 9780321811059, lire en ligne )
↑ Gary L. Miessler, Inorganic Chemistry, Prentice-Hall, 1999, 2^e éd. (ISBN 0-13-841891-8), p. 621-630
↑ (en) C. E. Housecroft et A. G. Sharpe, Inorganic Chemistry, 3^e éd., Prentice Hall, 2008, p. 111-112. (ISBN 978-0-13-175553-6)

[1] Alain Sevin et al., Chimie Générale - tout le cours en fiches, Dunod, 2012, p. 16-17

[2] Brian Pfennig, Principles of Inorganic Chemistry, Wiley, 191 p. (ISBN 978-1-118-85910-0)

[Pfennig-3] {a et b} Brian Pfennig, Principles of Inorganic Chemistry, Wiley (ISBN 978-1-118-85910-0)

[4] Gary Miessler, Inorganic Chemistry, Pearson, 2004 (ISBN 9780321811059, lire en ligne )

[5] Gary L. Miessler, Inorganic Chemistry, Prentice-Hall, 1999, 2^e éd. (ISBN 0-13-841891-8), p. 621-630

[978-0-13-175553-6-6] (en) C. E. Housecroft et A. G. Sharpe, Inorganic Chemistry, 3^e éd., Prentice Hall, 2008, p. 111-112. (ISBN 978-0-13-175553-6)

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