Le jeu prend place en 1968, pendant la guerre du Viêt Nam. Le joueur incarne Nate Walker, un jeune soldat Américain qui, à peine arrivé en Asie du Sud-Est, va être conduit au chevet de son frère, Cal. En effet, celui-ci est le dernier survivant d'une patrouille envoyée au Cambodge afin de récupérer le précieux contenu d'un avion qui s'est écrasé nommé l'Ange noir. Or, il s'agit d'un virus transformant les individus en cannibales et il semble que Cal l'ait contracté. Alors que ce dernier est soumis à des expériences menées par l'US Army, il parvient à s'enfuir dans la jungle Vietnamienne. Son frère va alors devoir le poursuivre à travers tout le Sud-vietnam, avec le soutien de l'armée Américaine, dans l'espoir de trouver un antidote au virus, alors que les Vietcong tentent de mettre eux aussi la main sur l'Ange noir et que l'infection se propage à grande vitesse.