Utilisateur:Phil94/Brouillon

Covidtracker est un site de suivi de l'épidémie de COVID19 créé par Guillaume Rozier (GRZ) un ingénieur en informatique de 24 ans spécialisé dans le traitement des masses de données (Data Science).Il est issu de Telecom Nancy (école d’ingénieurs en informatique, IMT Grand Est) et de l'institut Mines-Telecom Business School (ex. Telecom École de Management).

Au fil des mois Covidtracker est devenu une référence pour différents médias.

Principe de fonctionnement

Le site CovidTracker utilise un robot pout télécharger quotidiennement, les données publics provenant de:

- le portail Geodes par [1]Sante public France

- le portail de Insee

- le CSEE de [[John-Hopkins University]]

Une fois la base alimentée avec les données du jour, le site effectue des mises en forme afin de diffuser deux types de statistiques:

- Des tableaux de bord permettant de suivre et de mieux comprendre l'évolution de l'épidémie. Afin de lisser les effets des week-end, les chiffres sont généralement publiés sous forme d'une moyenne de sept jours glissants.

- Des outils spécifiques permettant, par exemple, d'estimer la date du prochain déconfinement.

CovidTracker est en constante amélioration

Les tableaux de bord "France"

Au 20 novembre 2020, Covidtracker propose, pour la France, les graphes suivants:

1- La vue d'ensemble

1.1- le nombre de cas positifs quotidiens exprimés en moyenne quotidienne sur une semaine glissante.

1.2- le nombre de personnes hospitalisées pour Covid 19

1.3- le nombre de personnes en réanimation pour Covid19

1.4- le nombre de décès hospitaliers quotidiens exprimés en moyenne quotidienne sur une semaine glissante.

[2] Ces quatre graphes peuvent être visualises en échelle linéaire ou logarithmique ou encore sous forme de croissance hebdomadaire.

1.5- l'évolution quotidienne , sur un même graphique, de cinq indicateurs: cas positifs, personnes en réanimation, personnes hospitalisées (hors réanimation), décès hospitaliers,

1.6- l'évolution de la situation des malades selon 4 situations: hospitalisés hors réanimation, en réanimation, rentrée a domicile, décédés.

2- L'activité du virus

2.1- La carte d'incidence présente le nombre de tests positifs sur une semaine dans chaque département, ramené à 100 000 habitants.

2.2- Le taux de reproduction dit "R effectif" estimé sur 7 jours glissants selon deux méthodes: le nombre de cas positifs et le nombre d'admissions aux urgences

2.3- Le taux de positivité : sur ce graphe, figure le nombre de tests réalisés et la proportion de tests positifs par rapport à l'ensemble des tests réalisés. Les données sont exprimées en moyenne sur 7 jours glissants.

2.4-Le nombre de nouveaux tests positifs par département

2.5- le nombre de cas positifs par région

2.6- le taux d'incidence dans les 22 métropoles française:

Il s'agit de l'incidence moyenne sur 7 jours glissants présenté sous forme de "carte de chaleur". Il est possible de limiter l'affichage a la seule population âgée de plus de 65 ans.

Depuis le mois d'octobre 2020 (seconde vague), deux graphes annexes comparent l'évolution du taux d'incidence dans les métropoles sous-couvre feu et hors couvre-feu.

2.7- La répartition des cas en fonction de l'âge.

Quatre graphes ventilant les donnes en 10 tranches d'âges de 10 ans chacune.

- 3 cartes de chaleur représentant le nombre da cas, l'incidence et le taux de positivité

- le dernier onglet donne la répartition par tranches d'âges des cas positifs

2.8: le taux d'incidence par région et par âge

3- Les indicateurs épidémiques

3.1- Le taux d'admission aux urgences pour coronavirus.

3.2- Le taux d'actes SOS Medecins

Ces deux graphes possedent une vue nationale et une vue par département. Les données sont obtenues en effectuant la moyenne mobile centrée sur 7 jours.

3.3- La saturation hospitalière:

Ce graphe exprime la saturation des services de réanimation par les patients Covid19 par rapport au nombre initial de lits de réanimation en France (fin 2018 selon la DRESS).

Cette donnée fait l'objet d'une attention particulière de la part des autorités sanitaire: on la retrouve notamment sur le tableau de bord de l'application TousAntiCovid.

Sur CovidTracker, ce graphique est déclinable par département.

4- Hospitalisations et réanimations liées au Covid-19

4.1 Evolution du nombre de personnes hospitalisées pour chaque tranche d'âge

4.2 Evolution du nombre de personnes en réanimation pour chaque tranche d'âge

4.3 Nombre de personnes en réanimation par tranche d'âge présentée sous forme d'animation temporelle

4.4 Nombre de personnes hospitalisées pour chaque région et par millions d'habitants

5- Les décès dus au Covid19

5.1 Nombre de décès hospitaliers quotidiens exprimes en moyenne mobile centrée sur 7 jours afin de lisser les week-end.

5.2 Comparatifs des décès cumulés et des décès cumulés par millions d'habitants pour les 18 régions françaises.

6- La mortalité en France

6.1 Comparaison du nombre de décès quotidiens des années 2018, 2019 et 2020 exprimées en moyenne sur 14 jours afin de lisser les irregularites.

Les tableaux de bord par "Régions" et "Departements

Ces tableaux de bord déclinent pour chaque région / département les graphiques suivants 1- L'évolution du nombre de cas positifs 2- L'évolution du nombre d'hospitalisations 3- L'évolution du nombre de personnes en réanimation 4- L'évolution du nombre de décès hospitaliers 5- L'évolution du taux d'occupation des lits de réanimation.

Les tableaux de bord "Monde"

Au 20 novembre 2020, Covidtracker propose, au niveau mondial, les graphes suivants:

1- Les cas confirmes de Covid19

1.1- le nombre de cas positifs quotidiens exprimés en moyenne quotidienne sur une semaine glissante.

1.2- le nombre de cas positif par pays quotidiens exprimes en moyenne quotidienne sur une semaine glissante. Ces graphes permettent de comparer l'évolution simultanée du Covid19 dans une vingtaine de pays. Il est possible d'utiliser un même axe pour l'ensemble des pays ou un axe spécifique dépendant de la population de chaque pays. Les chiffres sont exprimés en moyenne quotidienne sur 14 jours glissants.

1.3- le nombre de cas confirmes par pays un graphe représente l'évolution du nombre de cas confirmes pour une vingtaine de pays.

1.4- le nombre de cas confirmes par million d'habitants un graphe représente l'évolution du nombre de cas confirmes pour une vingtaine de pays par million d'habitant.

1.5- le nombre de cas confirmes par million d'habitants depuis l'atteinte d'un seuil de 20/1M: même graphe que le précèdent mais décale dans le temps afin que la courbe de chaque pays démarre a l'atteinte du seuil.

2- Les décès dus au Covid19

2.1- le nombre de décès quotidiens quotidiens exprimés en moyenne quotidienne sur une semaine glissante.

2.2- le nombre de décès par pays quotidiens exprimes en moyenne quotidienne sur une semaine glissante. Ces graphes permettent de comparer l'évolution simultanée du Covid19 dans une vingtaine de pays. Il est possible d'utiliser un même axe pour l'ensemble des pays ou un axe spécifique dépendant de la population de chaque pays. Les chiffres sont exprimés en moyenne quotidienne sur 14 jours glissants.

2.3- le nombre de décès par pays un graphe représente l'évolution du nombre de décès pour une vingtaine de pays.

2.4- le nombre de décès par million d'habitants un graphe représente l'évolution du nombre de décès pour une vingtaine de pays par million d'habitant.

1.5- le nombre de décès par million d'habitants depuis l'atteinte d'un seuil de 3/1M: même graphe que le précèdent mais décale dans le temps afin que la courbe de chaque pays démarre a l'atteinte du seuil.

Les Outils

Au 20 novembre 2020, CovidTracker propose 4 outils:

1- CoviDep

Cet outil constitue un comparateur de vagues: il présente les départements ayant dépassé le nombre d’hospitalisations pour Covid19 du pic de la première vague et ceux ne l’ayant pas encore dépassé.

En cliquant sur un département, l'utilisateur obtient un graphique représentant l'évolution au fil du temps du nombre de personnes hospitalisées.

2- Calculateur de risque Covid

Permet de déterminer la probabilité qu'une personne présente lors d'un rassemblement soit porteuse du Covid19 et puisse potentiellement devenir un super contaminateur

L'utilisateur sélectionne le département desire puis indique le nombre de personnes pressentes: l'outil calcule alors la probabilité.

Le site indique également, pour chaque département, le risque pour qu’il y ait une personne positive dans un événement de 6 personnes

3- Le comparateur de vagues

Permet la comparaison des courbes des hospitalisations, réanimations et décès hospitaliers pour les vagues 1 (printemps 2020) et 2 (automne 2020)

Le point de départ de chaque vague est fixe a la date du début de confinement.

4- Le calculateur de durée de confinement

L'utilisateur sélectionne une valeur du taux de reproduction Reffectif pour chaque semaine en faisant glisser les points sur une courbe. Le système calcule alors le nombre de cas hebdomadaire prévisibles au cours des semaines suivantes et déduit la durée nécessaire pour atteindre l'objectif de 35 000 cas hebdomadaires (5 000 cas quotidiens) fixe par le Président Emmanuel Macron .

Faiblesses du site

Comme tout agrégateur de données, la fiabilité des graphiques dépend de celle des sources. Des dysfonctionnements du portail Géodes et des remontées tardives de donnes ont provoques des traces statistiquement aberrants qui n'ont ete corriges que manuellement.

Covidtracker ne tient compte que des décès survenus en milieu hospitalier et "oublie" donc ceux survenus en EHPAD, EMS ou a domicile. Cependant, ces dernières données étant très volatiles, peu fiables et concernant une population particulieremen fragile, leur représentation sous forme graphique est peu pertinente pour suivre l'évolution de l' épidémie.

Les départements sont souvent tries par libelles et non par numéros.

Projet d'amélioration

Sur twitter et lors d'une interview sur France Info, l'auteur du site souhaite que les données du réseau Obépine, permettant de suivre l'évolution de l'épidémie dans les réseaux d'eaux usées, soient rendues publiques afin de mieux informer la population.

Site Officiel

CovidTracker