Cette troisième année (1998-1999) est celle de l'ascension vers les hauteurs de la division avec l'obtention d'une 4e place (20 victoires et 10 défaites)[1],[2]. ; l'équipe commence sa saison par une victoire 72 à 63 sur l'ASVEL sur son terrain[3] ; elle possède l'une des meilleures paires d'étrangers de « Pro A » (Keith Gatlin et Andre Owens), mais aussi d'autres joueurs, tels Kent Hill, Emmanuel Schmitt, David Robinson, Maurice Beyina, etc. qui sont des éléments clés dans un collectif huilé avec une défense de fer. À noter aussi les victoires contre le PSG-Racing 69 à 52 à Paris, 68 à 62 à Chalon[4] et contre Cholet à la Meilleraie par 70 à 67[5]. Mais le club chalonnais se fait éliminer deux manches à une en quart de finale des playoffs par le cinquième PSG Racing Basket (défaite à domicile 64 à 50 au match aller, victoire chalonnaise à Paris 53 à 51 au match retour et nouvelle défaite à la Maison des Sports 78 à 89 lors de la belle)[6]. Le club est éliminé en huitième de finale de la Coupe de France.