Stramenopiles (classification phylogénétique)
Cette page a pour objet de présenter un arbre phylogénétique des Stramenopiles (Heterokonta, Hétérocontes, Straménopiles), c'est-à-dire un cladogramme mettant en lumière les relations de parenté existant entre leurs différents groupes (ou taxa), telles que les dernières analyses reconnues les proposent. Ce n'est qu'une possibilité, et les principaux débats qui subsistent au sein de la communauté scientifique sont brièvement présentés ci-dessous, avant la bibliographie.
Arbre phylogénétique
modifierLe cladogramme présenté ici ne possède qu'une valeur indicative. Il n'est pas forcément consensuel, et on peut toujours se référer à la bibliographie au bas de l'article.
Le symbole ▲ renvoie à la partie immédiatement supérieure de l'arbre phylogénétique du vivant. Le signe ► renvoie à la classification phylogénétique du groupe considéré. Tout nœud de l'arbre portant plus de deux branches montre une indétermination de la phylogénie interne du groupe considéré.
Les habitudes typographiques des botanistes et des zoologistes sont différentes. Ici, par commodité de lecture, et certains groupes actuels relevant des deux domaines traditionnels, les noms de taxons supérieurs au genre sont tous écrits en caractères droits, les noms de genres ou d'espèces en italiques.
À la suite d'un taxon, sa période d'apparition, quand elle est connue, peut être indiquée suivant la légende suivante : (Plé) : Pléistocène ; (Pli) : Pliocène ; (Mio) : Miocène ; (Oli) : Oligocène ; (Éoc) : Éocène ; (Pal) : Paléocène ; (Cré) : Crétacé ; (Jur) : Jurassique ; (Tri) : Trias ; (Per) : Permien ; (Car) : Carbonifère ; (Dév) : Dévonien ; (Sil) : Silurien ; (Ord) : Ordovicien ; (Camb) : Cambrien ; (Edi) : Édiacarien. Pour plus de précision si possible, (-) : inférieur ; (~) : moyen ; (+) : supérieur.
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- ▲
- Heterokonta ou Stramenopiles
- Opalinata ou Slopalinida
- Placididea
- ...
- Bigyromonada ou Developayella
- ...
- Labyrinthulomycetes
- ...
- Bicosoecida ou Bicoecida
- ...
- Sloomycetes
- Hyphochytriomycetes ou Hyphochytriales
- Oomycota ou Peronosporomycetes
- Stramenochromes ou Heterokontophyta ou Ochrophyta
- Diatomeae ou Khakista
- Bolidophyceae ou Bolidomonadales
- Bacillariophyta
- Coscinodiscophyceae (paraphylétique ?)
- Bacillariophytina
- Attheya
- ...
- Cymatosirales
- Cymatosiraceae
- Rutilariaceae (éteint)
- Anaulaceae
- Biddulphiaceae
- Triceratiaceae
- Eupodiscaceae
- Pleurosiraceae
- Biddulphiopsis
- ...
- ...
- Bacillariophyceae
- ? Striatellaceae
- ...
- ...
- ...
- ...
- Eunotiophycidae ou Eunotiales
- Bacillariophycidae
- Phaeista
- ? Aurosphaeraceae
- Parmophyceae ou Parmales
- Hypogyrista ou Dictyochia
- Chrysista
- Pinguiophyceae
- ...
- ...
- Raphidophyceae ou Raphidomonadales
- Phaeistia
- Phaeothamniophyceae
- Chrysomerophyceae
- ...
- Aurearenophyceae
- Xanthophyceae ou Tribophyceae
- ? Schizocladiales
- Phaeophyceae
- Diatomeae ou Khakista
- Sloomycetes
- Heterokonta ou Stramenopiles
-
Diatomées au microscope électronique (×5000)
Débat scientifique relatif à la phylogénie des Stramenopiles
modifierLa monophylie du groupe des Chromistes n'est pas avérée. Les seuls Straménopiles pourraient être plus proches parents des Alvéolés, voire des Rhizaires, que des Haptophytes et Cryptophytes.
Au sein des Straménopiles, groupe récent réunissant des Algues et des taxons autrefois classés parmi les Champignons, la principale question est celle de l'acquisition de chloroplastes chez les Hétérocontophytes (ou Ochrophytes) ou, au contraire, de leur perte dans les autres taxons.
Classification selon Cavalier-Smith 1998
modifierCette classification n'est pas à proprement parler phylogénétique. Basée sur les nouvelles phylogénies, elle maintient néanmoins des taxons paraphylétiques, notamment à la base des lignées évolutives, par commodité. Elle maintient également les niveaux traditionnels de classification (règnes, phyla, classes, etc.).
- ▲
- infra-règne des Heterokonta
- super-embranchement des Sagenista
- embranchement des Sagenista
- sous-embranchement des Bicoecia
- ordre des Bicoecales
- ordre des Anoecales
- ordre des Pirsoniales
- famille des Pirsoniaceae
- sous-embranchement des Labyrinthista
- sous-embranchement des Bicoecia
- embranchement des Sagenista
- super-embranchement des Gyrista
- embranchement des Ochrophyta (peut-être paraphylétique)
- embranchement des Bigyra
- sous-embranchement des Bigyromonada
- sous-embranchement des Pseudofungi
- sous-embranchement des Opalinata
- super-embranchement des Sagenista
- infra-règne des Heterokonta
Classification proposée par Adl et al. 2005
modifierCe comité a proposé une nouvelle classification, remplaçant celle des anciens Protistes et tenant compte des phylogénies moléculaires récentes. Elle regroupe les Eucaryotes en six groupes réputés monophylétiques. Voici ce qui concerne les Stramenopiles.
En savoir plus
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Sources bibliographiques de référence
modifier- Sina M. Adl et alii (2005) « « The New Higher Level Classification of Eukaryotes »(Archive.org • Wikiwix • Archive.is • Google • Que faire ?) », J. Eukaryot. Microbiol., 52 (5), p. 399–451
- Kirill A. Mikrjukov et David J. Patterson (2001) « Taxonomy and Phylogeny of Heliozoa. III. Actinophryids »(Archive.org • Wikiwix • Archive.is • Google • Que faire ?), Acta Protozool., 40, p. 3-25
- Thomas Cavalier-Smith (1998) « A revised six-kingdom system of life », Biological reviews 73, p. 203-266
Autres sources bibliographiques
modifier- Cabioc'h, J., Floc'h, J.-Y., Le Toquin, A., Boudouresque, C.F., 2006. Guide des algues des mers d'Europe, Delachaux et Niestlé (éd.). (ISBN 260301384X).
- Bruno de Reviers, Biologie et phylogénie des algues, vol. 2 : tome 2, Paris, Belin, coll. « Belin Sup Sciences / Biologie », , 256 p. [détail de l’édition] (ISBN 2-7011-3512-5, ISSN 1158-3762)
Sources internet
modifierLiens internes
modifier- Arbre phylogénétique
- Chromista -- Laminaire -- Diatomée -- Mildiou (Oomycota)
- Le vivant (classification phylogénétique)
- Orientation bibliographique en botanique, phycologie et mycologie (taxinomie)
- Photo-guide taxinomique de la faune et de la flore sous-marine
- Photo-guide taxinomique du monde végétal