HOXD13

HOXD13
Identifiants
Aliases	HOXD13
IDs externes	OMIM: 142989 MGI: 96205 HomoloGene: 20147 GeneCards: HOXD13
Position du gène (Homme)
Chr.	Chromosome 2 humain
Fin	176,095,944 bp
Position du gène (Souris)
Chr.	Chromosome 2 (souris)
Fin	74,501,943 bp
Expression génétique
	Fortement exprimé dans
	urètre; ; vagin; ; muscle layer of sigmoid colon; ; ectocervix; ; tendon calcanéen; ; vésicule séminale; ; prostate; ; endocol; ; vulve; ; rectum;
	Fortement exprimé dans
	tubercule génital; ; left colon; ; main; ; tail of embryo; ; bourgeon de membre; ; rectum; ; pied; ; canal déférent; ; urètre; ; footplate;
	Plus de données d'expression de référence
	; ;
	Plus de données d'expression de référence
Gene Ontology
Fonction moléculaire	liaison ADN; sequence-specific DNA binding; DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific; liaison de chromatine; RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; cis-regulatory region sequence-specific DNA binding; DNA-binding transcription factor activity; sequence-specific double-stranded DNA binding;
Composant cellulaire	noyau;
Processus biologique	pattern specification process; skeletal system development; regulation of branching involved in prostate gland morphogenesis; male genitalia development; regulation of transcription, DNA-templated; limb morphogenesis; embryonic digit morphogenesis; embryonic hindgut morphogenesis; branch elongation of an epithelium; transcription, DNA-templated; développent d'un organisme multicellulaire; gland morphogenesis; regulation of cell population proliferation; embryonic limb morphogenesis; prostate epithelial cord arborization involved in prostate glandular acinus morphogenesis; anterior/posterior pattern specification; morphogenesis of an epithelial fold; transcription by RNA polymerase II; prostate gland development; response to testosterone; positive regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues
	3239
	15433
	ENSG00000128714
	ENSMUSG00000001819
	P35453
	P70217
	NM_000523
	NM_008275
	NP_000514
	NP_032301
	Wikidata
Voir/Editer Humain	Voir/Editer Souris

Le gène HOXD13 est un gène qui appartient à la famille des gènes homéotiques. Ce gène code la protéine HOXD13 chez l’Homme. Les gènes homéotiques possèdent une homéoboîte, séquence d’ADN hautement conservé au sein des organismes codant un domaine protéique appelé homéodomaine. Ce domaine protéique joue le rôle de facteur de transcription et est impliqué dans le plan d’organisation de l’animal selon les axes de polarité (axe dorso-ventral ; axe antéro-postérieur) et la morphogenèse chez tous les organismes multicellulaires. Quartes familles de gènes homéotiques sont retrouvées chez les mammifères : hoxa, hoxb, hoxc et hoxd. Ils sont tous situés sur des chromosomes différents mais les gènes appartenant à la famille HOXD sont situés sur le chromosome 2. Le rôle de ce gène a été élucidé et continue à être étudié en générant des mutants chez les rongeurs ou même des tritons ^[5]^,^[6]. Le produit du gène hoxd13 chez la souris joue un rôle dans le développement du squelette axial et dans la morphogénèse des membres. La délétion de ce gène entraîne des anormalités au niveau génital, de leurs membres, appendice, certains éléments squelettiques. Des mutations qui lui sont associées mènent notamment à la synpolydactylie ainsi qu’à la brachydactylie^[7].

Rôle dans les patrons de formation

Plusieurs études ont mis en évidence le rôle de HOXD13 dans le développement des membres antérieurs et postérieurs ainsi que son rôle dans la régénération des membres chez les tritons. L'équipe de Takeuchi tentent en effet d’identifier un gène homéotique qui jouerait un rôle dans le développement et la régénération des membres et ainsi élucider les processus qui y sont mis en place^[5]. À ce jour, aucune preuve génétique ne permet de lier la fonction des gènes homéotique et la régénération des membres. L’équipe s’est donc penchée sur la fonction du gène hoxd13, connu pour avoir des capacités régénératrices dans de nombreux tissus. Ils se sont donc demandé si hoxd13 avait un rôle dans le développement et la régénération des membres et en quoi ce gène influence la morphogénèse de ces derniers? Pour répondre à cette question, les chercheurs ont donc fait appel au système génétique de knockout du gène en question pour étudier ces effets au niveau de la morphogénèse chez les tritons. Dès lors, ils observent une perte des appendices, des os metacarpien et metatarsiens chez les mutants. Ces résultats viennent confirmer l'implication de hoxd13 dans les processus de régénération et de développement des membres chez les tritons. En effet, ce gène permet le bon développement de la région distale des membres et des appendices. De plus, ces données concluent que ce gène a les mêmes fonctions que ce soit dans le développement ou dans la régénération. Une deuxième équipe, celle de Pascal Dollé, a pour but quant à elle, d’attribuer un rôle au gène hoxd13 pour ainsi étudier la morphogénèse des membres sur un plan évolutif^[6]. Les gènes hoxd des vertébrés étant déjà connu pour être activé lors de la morphogénèse et la formation des membres. L'équipe se demande donc en quoi le gène hoxd13 est un acteur dans la morphogénèse des membres ? Pour tenter de répondre à cette question, l’équipe a généré des souris mutantes pour le gène hoxd13 et des souris dont ce gène a été délaissé ainsi que des techniques de recombinaison homologue dans des cellules souches de l’embryon. Leurs résultats notent bien une réduction dans la longueur d’éléments squelettiques, une perte des phalanges, la fusion d’os et la présence d’éléments rudimentaires supplémentaires. Ces résultats viennent confirmer que hoxd13 joue un rôle dans le patron de formation des membres chez les mammifères. Effectivement, ce gène contrôle la formation squelettique selon tous les axes du corps dont l'axe génital. L'ensemble de ces données suggère également que l'implication du gène en question dans l'évolution des membres chez les tétrapodes.

Développement des appendices

Il semblerait que hoxd13 contrôle plus précisément, avec l’aide du gène hoxa13, le bon développement du segment distale ou autopode des membres, chez les mammifères et sa régénération chez les tritons^[5]. L’évidence repose sur la génération de souris mutantes dont les appendices des membres ont subi des altérations. Cette mutation affecte le développement des structures postaxiales de l’autopode. La taille des phalanges du majeur et de l'annulaire diminuent ainsi que la taille de leurs index et auriculaire . Cette diminution serait le résultat de la déformation et la réduction des os du métacarpe et du metatarse. Les os sesamoïdes sont également altérés : ils disparaissent, subissent une réduction de taille ou fusionnent avec les éléments squelettiques des phalanges. Cette observation est en accord avec les évidences pour lesquelles des mutations de ce gène mènent à la brachydactlylie chez l’Homme^[7]. Le pouce des mutants a également été touché, perdant toute articulation. L’absence de hoxd13 a entraîné la perte de segmentation du cartilage du métacarpe. Ainsi, ce gène semblerait également contrôler la segmentation des cartilages du métacarpe au niveau des membres antérieurs et postérieurs. Ces résultats suggèrent que l’absence de ce gène homéotique entraîne une modification de la morphologie des os en interférant avec la division cellulaire ou la croissance cellulaire locale.

Altération au niveau de l'axe du corps et de l'axe génital

En plus de contrôler la morphogenèse des appendices, hoxd13 semblerait influencer divers éléments squelettiques comme les vertèbres ou même, l’axe génital. L’équipe de Pascal Dollé s’est penchée sur la question et étudie le phénotype des mutants du gène hoxd13 au niveau des vertèbres et du squelette. En effet, différentes altérations en découlent. Premièrement, au niveau du sacrum, les mutants montraient 4 vertèbres fusionnées à la place de 3. Au niveau du pénis, la morphologie de l’os pénien est altérée et les parties proximales du pénis voient leur taille diminuer. Ces évidences expérimentales viennent confirmer que hoxd13 est un acteur majeur dans le développement des membres, des appendices et de leurs structures osseuses. La forme des os étant changée montre ainsi que hoxd13 est impliqué dans l’organisation des patrons développementaux.

Rôle dans l'évolution du développement

Heterochronie

La délétion du gène hoxd13 induit des retards de croissance sévères au niveau des cartilages de la région autopode des membres ou même l’absence de certains éléments cartilagineux qui sont les derniers à se développer chez les modèles wild type. Ainsi, hoxd13 induit une hétérochronie, c’est-à-dire la réduction de la vitesse de développement des éléments squelettiques de la région autopode des membres. Une mutation au niveau de ce gène provoque des retardements développementaux de quelques jours menant à un phénotype juvénile visible à la naissance. À la suite de ce phénotype, l’adulte muté possède des membres à caractéristiques néoténique, paraissant atavistiques. De plus, les gènes hox pourraient contrôler le patron de formation des membres en régulant la séquence temporelle et la vitesse de croissance de divers éléments^[6]. Le patron de développement des membres serait donc soumis à une activation temporelle spécifique des complexes des gènes hox, autrement appelé une colinéarité temporelle^[6].

Le point de vue évolutif

Chez le poisson-zèbre, la délétion de hoxd13 diminue la taille des nageoires. D’autres études entreprises sur le marsupial ^[8] ou la roussette (Scyliorhinidae) ^[9]ont également confirmé la réduction de taille de leurs appendices respectifs en l’absence du gène hoxd13. Ces résultats expérimentaux mettent en évidence le rôle que joue hoxd13 dans la formation des régions distales des appendices et suggèrent surtout, qu’un changement dans son patron d’expression chez les poissons à nageoires lobées a pu contribuer à l’évolution des membres chez les tétrapodes.

Notes et références

↑ ^{a b et c} GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000128714 - Ensembl, May 2017
↑ ^{a b et c} GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000001819 - Ensembl, May 2017
↑ « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
↑ « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
↑ ^{a b et c} (en) Takashi Takeuchi, « The roles of hox 13 genes in newt limb development and regeneration », Biorxyv,‎ 1^er octobre 2019
↑ ^{a b c et d} (en) Pascal Dollé, « Disruption of the Hoxd-13 Gene Induces Localized Heterochrony Leading to Mice with Neotenic Limbs », Cell (75),‎ 5 novembre 1993, p. 431-441
↑ ^{a et b} (en) Temtamy, S.A, « Brachydactyly », Orphanet Journal of Rare Diseases (3):15,‎ 2008
↑ (en) « Key genetic event underlying fin-to-limb evolution: Study of catsharks reveals how alterations in the expression, function of certain genes in limb buds underlie evolution of fish fins to limbs », sur Science daily (consulté le 28 novembre 2019)
↑ (en) « Key genetic event underlying fin-to-limb evolution: Study of catsharks reveals how alterations in the expression, function of certain genes in limb buds underlie evolution of fish fins to limbs », sur science daily (consulté le 27 novembre 2019)

Voir aussi

[refGRCh38Ensembl-1] {a b et c} GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000128714 - Ensembl, May 2017

[refGRCm38Ensembl-2] {a b et c} GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000001819 - Ensembl, May 2017

[3] « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine

[4] « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine

[:1-5] {a b et c} (en) Takashi Takeuchi, « The roles of hox 13 genes in newt limb development and regeneration », Biorxyv,‎ 1^er octobre 2019

[:2-6] {a b c et d} (en) Pascal Dollé, « Disruption of the Hoxd-13 Gene Induces Localized Heterochrony Leading to Mice with Neotenic Limbs », Cell (75),‎ 5 novembre 1993, p. 431-441

[:0-7] {a et b} (en) Temtamy, S.A, « Brachydactyly », Orphanet Journal of Rare Diseases (3):15,‎ 2008

[8] (en) « Key genetic event underlying fin-to-limb evolution: Study of catsharks reveals how alterations in the expression, function of certain genes in limb buds underlie evolution of fish fins to limbs », sur Science daily (consulté le 28 novembre 2019)

[9] (en) « Key genetic event underlying fin-to-limb evolution: Study of catsharks reveals how alterations in the expression, function of certain genes in limb buds underlie evolution of fish fins to limbs », sur science daily (consulté le 27 novembre 2019)

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