Discussion Projet:Biologie/Le café des biologistes/Archives/Discussion Portail Biochimie 2006-2007

Bienvenue à tous !!!...

Bienvenue à tous sur ce nouveau portail, consacré à la biochimie !... Si cette discipline peut, pour certains, être synonyme de mal de tête, voire de crises d'angoisse (!), nous pouvons vous assurer qu'elle n'en est pas moins passionnante (si si, c'est juré) !... Tous vos commentaires, suggestions ou critiques sont cordialement attendus et encouragés sur cette page. Elapied 12 février 2006 à 11:29 (CET)

Chimiebox

Bonjour, un petit mot pour vous informer de la création d'un nouveau modèle : les chimiebox.

Ils permettent de placer un tableau regroupant les informations chimiques (élargies ou non) à gauche de l'article. Ces modèles sont conçus sur le même principe que celui des taxobox ainsi ces modèles s'imbriquent les uns dans les autres en fonction des champs que vous désirez ou non remplir. Ce principe a été choisi pour sa forme évolutive qui permet d'ajouter sans fin d'autres modèles en fonction des besoins.

Ces modèles ont été établis grâce à une coopération des portail de chimie, projet médecine et projet psychotrope.

Vous en découvrirez le mode d'emploi complet sur Projet:Charte graphique/Utilisation des chimiebox et une page récapitulant les différents modèles en service est sur modèle:chimieboxes.

Merci de ne pas modifier ces modèles sans en parler préalablement sur la page de discussion. sand 5 mars 2006 à 12:19 (CET)

PCR et articles associés

Bonjour à tous, j'ai comme premier projet de faire une remise à neuf de l'article PCR et des pages associées existantes ou non (RT-PCR, PCR quantitative, nested PCR, ...). Je vous avertirai lorsque je penserai avoir terminer la première ébauche. Donnez-moi vos avis/conseils/critiques,... --Ygonaar 7 mars 2006 à 01:42 (CET)

Bonne idée. Bienvenue à toi. Moez ^m'écrire 7 mars 2006 à 05:15 (CET)

lapoire

bonjour, en effet j'aimerer m'inscrire comment faire?

C'est fait !... Je viens d'inscrire ton nom sur le portail à la section "Participants..." (bas de la page). Les différentes sections au bas du portail donnent des indications quant à comment contribuer, certains sujets ayant besoin d'être développés, etc... Il n'y a, bien sur, aucune obligation et tu peux créer/développer les articles qui t'interessent le plus. Si tu as des questions, n'hésites pas à me contacter ou à contacter les autres contributeurs... Elapied 15 mars 2006 à 17:39 (CET)

orgone

Suite à une guerre d'édition, je vous invite a lire cet article sur une théorie qui remet en cause les principes de physiques (thermodynamique), de la biochimie (pasteur)... et d'y participé si vous le désirez merci. Vincnet G 24 avril 2006 à 11:26 (CEST)

Relookage !...

Salut à tous ! Il fallait bien un relookage de l'en-tête des 2 portails Biochimie et BCM... C'est chose faite ! N'hésitez pas à faire part de vos commentaires !... :) Elapied 21 mai 2006 à 19:54 (CEST)

Techniques de biologie moléculaire

Bonjour,

serait-il possible de jeter un coup d'oeil sur Techniques de biologie moléculaire? J'ai juste essayé de classer un peu tout ca car c'était un joyeux bazar... Peut-etre faut-il fusionner la page avec une autre

Salut Jajaloic ! Je suis coincé pour l'instant question temps... Dès que possible je jette un coup d'oeil. Ce qui est sûr, c'est que cet article est un des plus importants des disciplines bioch/bio cell/bio mol ! Les tech de bio mol sont rarement présentées de façon synthétique, ce qui est pourtant fondamental pour s'y retrouver, notamment pour les étudiants... Merci de te coller à cet article !... (ça serait bien qu'on essaie un de ces jours d'en faire un article de qualité, d'ailleurs) :) Elapied 24 mai 2006 à 21:36 (CEST)

Différents séquençages

Bonjour,

Je me demande comment on doit s'organiser pour les différents séquençages, on peut parler de séquençage de l'ADN (et doit dont le séparer du séquençage du génome?) et aussi du séquençage des protéines. Bref ca serait bien de se mettre d'accord pour bien organiser tout ca! jajaloic 29 mai 2006 à 12:40 (CEST)

Biomolécules

J'ai noté 2 petits soucis dans la partie Biomolécules mais n'est pas pu les corriger, aussi, je préviens tout le monde.

• soucis n°1 : Les lipoprotéines possèdent 2 puces. Du coup, le reste de la liste se retrouve décalé
• soucis n°2 : Les stéroïdes et les stérols sont différenciés. Or, sauf erreurs de ma part, les stéroïdes appartiennent bien à la catégorie des stérols.

-- Foobar 4 juillet 2006 à 18:25 (CEST)

Merci de le signaler. Ca va être réglé au plus vite. Elapied 5 juillet 2006 à 03:18 (CEST)

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En fait, j'avais un gros soucis avec la liste des biomolecules (Dieu que j'ai horreur de ce terme). Son principale probleme est son manque de pertinance : exemples et categories de molecules etaient melanges! du coup, les peptides se retrouvaient coinces entre la tubuline et l'hemoglobine. De plus, une longue liste d'exemple est forcement rebarbative et ennuie le lecteur. Par exemple, dans le cas des proteines, il serait plus judicieux de donner les differentes classes de proteines (en suivant le schema d'une base de donne) et de donner qq exemples cles plutot que d'en faire la liste exhaustive. A ce propos, j'ai modifie la liste des lipides qui etait incomplete et en partie fausse ainsi que celle des acides nucleiques (je crois me souvenir que le xanthophylle etait classe dedans!!!!). J'ai egalement virer les liens vers Hormone, Biomolecules, suc gastrique et je sais plus quoi : cette suite n'avait pas vraiment de but si ce n'est d'etre fourre-tout apparemment. Enfin, j'ai rebaptide le lien vers la Banque de Donnes des Proteines PDB et non BDP. Le sigle de BDP n'est aboslument jamais utilise. C'est uniquement le sigle de PDB aui est retenu. Certaine peuvent le deplorer mais il me semble plus judicieux de mettre le nom d'usage (mais apres tout, traduit-om George Walker Bush en Georges Marcheur Buisson?)

PS: la classification des lipides pourra en choquer certains. Je les invite a consulter l'article sur les lipides pour y trouver la source de cette classification

-- Foobar 18 juillet 2006 à 18:04 (CEST)

Bonjour Foobar ! Il est clair que la présentation des articles avait beasoin d'un gros coup de carcher ! Merci de t'être attelé à la tâche ! Par ailleurs, il n'est, en effet, pas utile d'indiquer tous les articles de wikipédia sur le sujet mais seulement les plus pertinents. Pour l'ensemble des articles, je viens d'ajouter en bas de cadre un lien vers la catégorie concernée. N'hésites pas à faire toutes les modifs que tu juges nécessaires. A la fin de l'été, en sept, j'envisage de relooker entièrement ce portail (tes modifs actuelles seront évidemment maintenues). Je trouve qu'il a plus l'allure d'un annuaire qu'autre chose, pour l'instant. Elapied 18 juillet 2006 à 19:50 (CEST)

Oups petite erreur, j'ai oublie la categorie Autres pour parler des alcaloides et ce genre de chose. Il faudra surement trouver un nom plus approprie tot ou tard... En attendant, je pense que le portail serait plus sexy avec plus de jolies images... C'est la probablement que le bat blesse: tout ce qui tourne autour de la biochimie et de la biologie cellulaire et moleculaire manque cruellement d'illustrations de qualites! En tout cas, bon courage pour la remise en forme du portail ! -- Foobar 18 juillet 2006 à 20:14 (CEST)

C'était effectivement ça le gros problème. Les belles images étaient très rares (au moment de la création du portail et encore aujourd'hui) et il fallait éviter les redondances avec le portail Biologie cellulaire et moléculaire. J'espère que d'ici sept on aura plus de ressources pour rendre tout ça un peu plus vivant !... :) Elapied 18 juillet 2006 à 20:19 (CEST)

Au fait, félicitation pour ton article : Insertion cotraductionnelle des protéines membranaires. C'est le genre d'article qui manque trop souvent : détaillé, superbement illustré et bien référencé !... Elapied 18 juillet 2006 à 20:25 (CEST)

Merci mais je n'ai pas fait grand chose finalement> C'est un truc aue j'avais redige pour ma these. Le plus difficile a ete de le formater aux standard de Wikipedia. D'ailleurs, je ne suis toujours pas sur que le formatage des references est correct. Le plus dur, c'est de rediger les articles "from scratch". Ca demande enormement de temps de lire la bibliographie! -- Foobar 18 juillet 2006 à 21:53 (CEST)

Liste de référence

Bonjour,

J'ai mis en place une liste des publications en sciences, tous les scientifiques quel que soit leur domaine sont invités à y participer. Le principe est simple : une page est prévue pour chaque "grand" domaine scientifique (ajouter-la). Il suffit d'y ajouter toutes les références qu'on considère comme importantes.

Ektoplastor, 18 Juillet 2006, 14:15

A propos de references, qq1 connait-il le format a adopter? J'ai consulter la page d'aide Wikipédia:Conventions bibliographiques mais je m'y suis completement perdu! Du coup, j'ai adopter un format proche de ce que je trouve dans la plupart des journaux scientifiques que je consulte a savoir:

Auteur1 A., Auteur2 A. et Auteur 3 (2006) Titre de l'article, Nom du Journal, vol.(issue):de-à

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Foobar 24 juillet 2006 à 22:20 (CEST)

Je crois qu'il n'y en a tout simplement pas d'officiel ! Les Conventions bibliographiques (qui partent dans tous les sens d'ailleurs) ne parlent pas vraiment des publications scientifiques, et dans les pages concernées, chacun fait un peu ce qu'il veut... Par ex, j'utilise personnellement le format :

Auteur1, A., Auteur2, A., Auteur3, A., 2006. Titre de l'article. Nom du Journal, vol.(issue): de-à.

Donc soit on continue comme ça, soit on décide d'uniformiser le formats des publications... Elapied 25 juillet 2006 à 08:43 (CEST)

je suis tombe sur la page Wikipédia:Citez vos sources. La, ils explique que le formatage des articles et des bouquins peut etre le suivant :

livre : Michel Pastoureau, Une histoire symbolique du Moyen Age occidental, Seuil, coll. « La Librairie du XXIe siècle », Paris, 2004.
article : Jean-Pierre Rumen, « Pour une clinique de l'expertise », dans Journal français de psychiatrie, no 13 (2001), p. 46-49.

Honnetement, du moment que toute les info y sont (nom, titre, journal, etc.), tout me va. Mais bon, par soucis d'homogeneite, je veux bien qu'on se mette d'accord sur un format et celui propose par Wikipedia me convient tout a fait. -- Foobar 25 juillet 2006 à 17:08 (CEST)

Personnellement je n'aime pas trop leur formule, mais c'est plus par habitude (intégrisme?) liée aux revues que j'ai l'habitude de lire qu'autre chose. En fait, tout me va aussi du moment que toutes les infos y sont... s'il faut choisir un format, peut-être que le mieux serait de choisir le plus courant (si tant est qu'il y en ait réellement un). Ou alors le format le plus couramment déjà utilisé sur wikipédia (je n'ai jamais vraiment regardé si tout le monde suit les indications de Wikipédia:Citez vos sources). Je propose de transférer cette discussion vers le projet BBCM pour que les gens de bio mol et bio cell puisse y participer, et de prendre une décision rapide. C'est d'accord ? Elapied 25 juillet 2006 à 20:30 (CEST)

Ok, ca me va! -- Foobar 25 juillet 2006 à 23:17 (CEST)

Lumière sur...

Salut à tous ! Une nouvelle page est née associée au portail. Elle a pour but de permettre une consultation des archives des articles mis en lumière, ainsi que, pour ceux qui le désire, de proposer de nouveaux articles à mettre en accroche sur le portail. Si un article a retenu votre attention ou vous tient à coeur, n'hésitez pas !... Elapied 19 juillet 2006 à 10:53 (CEST)

Articles a rajouter

Bonjour

je me dit qu'il serait bien de rajouter deux articles au portail: -eau -chimie prébiotique (non crée)

j'insiste surtout sur l'eau qui entre pleinement dans la biochimie et qui à deja été crée!

jajaloic 1 août 2006 à 23:06 (CEST)

L'article eau a été ajouté au portail. Chimie prébiotique est un article très demandé et depuis longtemps ! Si tu te sens de l'attaquer, n'hésites pas !... :) Elapied 2 août 2006 à 10:45 (CEST)

Merci pour l'eau.Pour la chimie prébiotique il faut que je me fasse une bibliographie pour m'y lancer, des sites internet font des bonnes explications sur la chimie prébiotique, il pourrait etre interessant de voir s'il est possible de l'utiliser comme base jajaloic 8 août 2006 à 12:22 (CEST)

Article de qualité

Bonjour,

je me demande s'il n'est pas temps de chercher des articles que l'on pourrait proposer comme étant de qualité. Je pense déja à celui de l'eau qui me parait très bon. Seulement j'aimerai qu'on confirme que c'est une bonne idée de le proposer comme étant de qualité.

jajaloic 14 août 2006 à 23:24 (CEST)

Paul Nurse

Je viens de traduire cette biographie et j'ai un problème avec deux liens, cycline pointe sur une famille d'antibiotiques et je n'ai pas pu trouver de traduction de cyclin-dependent kinase - phe 4 septembre 2006 à 22:25 (CEST)

des enzymes kinases dépendante de la cycline - phe 10 septembre 2006 à 14:21 (CEST)

Élaboration d'une recommandation sur …

… Discussion Wikipédia:Formule chimique. VIGNERON * ^discut. 25 novembre 2006 à 13:34 (CET)

Acide gras et plus encore

Bonjour à tous, l'article acide gras progresse à grand pas ces temps-ci. Par contre, il reste beaucoup de travail sur les articles associés: oméga-3, oméga-6, oméga-9, acide gras essentiel, et bien d'autres... A vos claviers et à votre PubMed! -- Foobar 6 décembre 2006 à 08:04 (CET)

A propos de la notion d'essentiel

Bonjour à tous,

Je bute sur la notion d'essentiel et d'indispensable en biochimie. Je me souviens très bien de mes cours disant d'un acide aminé essentiel est un acide aminé qui n'est pas synthétisé ou synthétisé en quantité insuffisante par un organisme tandis qu'un acide aminé indispensable est uniquement un acide aminé qui n'est pas synthétisé du tout. Dans les deux cas, un apport par l'alimentation est nécessaire. Or, je n'arrive à retrouver cette nuance nulle part. J'ai bien cherché sur Google mais je n'ai rien trouver qui m'ait convaincu. Certains sites définissent « essentiel », d'autres « indispensable », mais aucun ne parle des deux à la fois. Quelqu'un pourrait-il confirmer (ou infirmer) cette nuance? Notez que je ne l'ai jamais vu apparaître en anglais où l'on parle uniquement d'« essential amino acids ». Merci.

-- Foobar 9 décembre 2006 à 21:05 (CET)

Relooking du portail

Salut à tous ! Je viens de procéder à un relooking du portail, histoire de le rendre moins austère qu'il n'était. Je crois qu'il en avait bien besoin !... De plus, le nouveau format permet un meilleur affichage avec certains navigateurs. Si vous avez le moindre commentaire ou remarque, n'hésitez pas !... :) Elapied 17 décembre 2006 à 05:20 (CET)

comment intégrer un nouvel article?

Bonjour, j'ai inséré sur Wikipédia ([1]) un (modeste ) article sur les cires que j'aimerai associer à l'un des chapitres du portail Biochimie. Comment dois-je procéder? Merci d'avance -- 31 janvier 2007 à 11:26 (CET)

C'est fait. Tu pourras voir le code ici. Mais la règle sur wikipédia est que tous les titres d'articles sont au singulier, et l'article Cire existe déjà. Donc soit il s'agit du même sujet et il faut fusionner les 2 articles, soit le sujet est différent et il faut créer une page de synonymie. A bientôt. Elapied 31 janvier 2007 à 11:49 (CET)

cires/cire

j'ai fusionné l'article nommé "Cires" (que j'ai créé), avec l'article "Cire". Je ne sait pas toutefois comment supprimer l'article "cires" devenu redondant? Quelqu'un a-til l'info?

Pour supprimer un article, il faut le demander auprès d'un Administrateur ou sur WP:SI. Dans ton cas, un redirect suffit : cires. VIGNERON * ^discut. 5 mars 2007 à 09:34 (CET)

Techniciens ChemScketch ou LaTeX spécialisés en représentation chimique

Bonjour à tous, je suis sur le point d'écrire quelques articles sur les vitamines liposolubles, et je me heurte à un problème : leur représentation semi-développée, ainsi que leurs réactions chimiques. Je me rends compte qu'il m'est assez difficile de dessiner les molécules, et ayant deux mains gauches celà me prend un temps fou jusqu'à parfois me décourager. C'est pourquoi je me demandais si il existait une page où l'on pouvait trouver des personnes douées pour les fabriquer (un peu comme la page de demande de traitement d'image) ou, si elle n'existe pas, la créer afin de compléter et remplir petit à petit les articles concernant la biochimie et la chimie en général.
En vous remerciant d'avance, FightForYourMind 29 avril 2007 à 01:14 (CEST)

Liste de suivi commune du Portail/Projet

Afin de favoriser le travail communautaire, pensez à exploiter au maximum toutes les possibilités du logiciel MediaWiki. Il est ainsi possible de bénéficier d'une liste de suivi commune dont la mise en place est très facile.

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Exemple avec le Portail:Stargate :

A partir de la liste Modèle:Portail Stargate/Suivi (qui est parfois nommé Index sur d'autres portails), il suffit de se rendre sur Special:Recentchangeslinked/Modèle:Portail_Stargate/Suivi pour visualiser facilement toutes les modifications sur les articles en rapport avec le portail ci-dessus.

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Cette méthode est facilement généralisable et peut vous aider à vous tenir au courant et suivre le travail des autres membres du Portail/Projet.

Pour plus d'informations, n'hésitez pas à me contacter ou à déposer une requête aux bots pour être aidé lors de la création de la liste.

Chico (blabla) 12 mai 2007 à 13:20 (CEST)