Le prologue s'est déroulé le 4 juin 2006 autour d'Annecy (contre la montre de 4,1 km.)
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Classement général
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La première étape s'est déroulée le 5 juin 2006, entre Annecy et Bourgoin-Jallieu, sur une distance de 207 km.
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Classement général
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La deuxième étape s'est déroulée le 6 juin 2006, entre Bourgoin-Jallieu et Saint-Galmier, sur une distance de 203 km.
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Classement général
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La troisième étape s'est déroulée le 6 juin 2006.
Il s'agit d'un contre-la-montre de 43 kilomètres autour de Bourg-de-Péage.
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Classement général
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La quatrième étape s'est déroulée le 8 juin entre Tain-l'Hermitage et le Mont Ventoux sur un distance de 186 km.
Dès le 5e kilomètre, une échappée se forme, composée de Stéphane Augé (Cofidis), Lars Ytting Bak (CSC), Danilo Napolitano (Lampre-Fondital), Joost Posthuma (Rabobank), Ronny Scholz (Gerolsteiner), Florian Stalder (Phonak), Alessandro Vanotti (Milram), Cédric Vasseur (Quick Step-Innergetic) et Thomas Voeckler (Bouygues Telecom). Aucun de ces coureurs n'est inquiétant au classement général et les équipes de leaders régulent l'allure du peloton et ne laissent jamais plus de six minutes d'avance aux échappés qui sont presque revus au moment où débute l'ascension du Mont Ventoux.
La sélection se fait très vite, et une vingtaine de coureurs se détachent du peloton dès les premières kilomètres de la montée. On y retrouve notamment Mikel Astarloza, Pietro Caucchioli, Sylvain Chavanel, Andrey Kashechkin, Bernhard Kohl, Floyd Landis, Levi Leipheimer, Francisco Mancebo, Denis Menchov, Christophe Moreau, Sérgio Paulinho, Óscar Pereiro, Didier Rous, Óscar Sevilla et Alejandro Valverde. Alexandre Vinokourov (Astana-Würth), pourtant vainqueur ici-même l'an dernier, ne parvient pas à tenir le rythme du groupe et se fait décrocher très rapidement, tout comme le Maillot Jaune Philippe Gilbert (Française des jeux).
En tête, les neuf échappés se sont écroulés les uns après les autres.
José Azevedo (Discovery Channel) tente de partir seul. Le coureur portugais effectue une bonne partie de l'ascension seul en tête, avec une trentaine de secondes d'avance sur le groupe des favoris. Mais à 5 kilomètres de l'arrivée, Levi Leipheimer (Gerolsteiner), Denis Menchov (Rabobank) et Christophe Moreau (AG2R Prévoyance) contre-attaquent. Ils rejoignent José Azevedo qui ne peut les suivre. Enfin, Levi Leipheimer décroche à son tour dans les derniers lacets.
Christophe Moreau et Denis Menchov arrivent ensemble au sommet, et c'est ce dernier qui l'emporte au sprint devant le Français.
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Classement général
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La cinquième étape s'est déroulée le vendredi 9 juin entre Sisteron et Briançon. Cette étape passait notamment par le col de l'Izoard avant de redescendre sur Briançon et gravir la montée de la Gargouille.
Elle a été remportée par Ludovic Turpin (AG2R Prévoyance) au terme d'une longue échappée partie dès le 35e kilomètre, composée aussi de Thor Hushovd et Jérôme Pineau, qui seront lâchés dans l'ascension de l'Izoard. Au sommet, Ludovic Turpin parvient à garder 40 secondes d'avance sur le peloton des favoris, composé de 6 hommes (Christophe Moreau, Levi Leipheimer, Denis Menchov, Iban Mayo, Eddy Mazzoleni, Leonardo Piepoli) , qui temporisent alors, permettant ainsi le retour de Pietro Caucchioli, George Hincapie, Bernhard Kohl et Francisco Mancebo.
Malgré l'attaque d'Iban Mayo accompagné de Francisco Mancebo, Ludovic Turpin ne sera pas rejoint et remporte ainsi la victoire au terme de 115 km d'échappée.
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Classement général
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La sixième étape s'est déroulée le 10 juin 2006 entre Briançon et La Toussuire, et passait notamment par le col du Galibier et le col du Mollard pour finir par l'ascension de la montée vers la station de La Toussuire.
C'est Iban Mayo qui l'emporte en échappée, montrant ainsi des qualités de grimpeur qu'il n'avait plus affichées depuis des années.
Ludovic Turpin, vainqueur la veille, chute dans la descente du col du Mollard, se fracturant le col du fémur.
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Classement général
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La septième et dernière étape s'est déroulée le 11 juin 2006, entre Saint-Jean-de-Maurienne et Grenoble, sur une distance de 131 km.
Longtemps échappé, Stuart O'Grady est finalement repris dans les tout derniers kilomètres par les équipiers de Thor Hushovd qui remporte le sprint.
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Classement général
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Philippe Gilbert
Denis Menchov
Ludovic Turpin
Iban Mayo
Thor Hushovd
Bernhard Kohl
José Azevedo
Leonardo Piepoli
