La saison 1999 du Championnat de Bolivie de football est la vingt-cinquième édition du championnat de première division en Bolivie. Le championnat est scindé en deux tournois saisonniers dont les deux vainqueurs s'affrontent en finale pour le titre national.
C'est Club Blooming, tenant du titre, qui remporte à nouveau la compétition cette saison après avoir battu The Strongest La Paz en finale nationale. C'est le troisième titre de champion de Bolivie de l'histoire du club.
Le club vainqueur du championnat se qualifie pour la prochaine édition de la Copa Libertadores accompagné par le club battu en finale nationale. De plus, un autre club se qualifie pour la Copa CONMEBOL 1999. Une troisième place est attribuée au vainqueur du barrage entre le finaliste du tournoi Ouverture et le deuxième de l'Hexagonal du tournoi Clöture.
Le barème utilisé pour établir l'ensemble des classements est le suivant :
- Victoire : 3 points
- Match nul : 1 point
- Défaite : 0 point
- Bolivar La Paz est directement qualifié pour la Copa Libertadores car il a à la fois terminé à la 2e place du tournoi Ouverture et à la 2e place de l'Hexagonal.
Un classement sur l'ensemble des deux phases régulières de la saison est réalisé. Le dernier est directement relégué, l'avant-dernier doit disputer un barrage de promotion-relégation face au deuxième du Torneo Simon Bolivar, la deuxième division bolivienne.
