La saison 2006 du Championnat d'Équateur de football est la quarante-huitième édition du championnat de première division en Équateur.
Dix équipes prennent part à la Série A, la première division, qui reprend le mode de fonctionnement d'avant 2005, à savoir deux tournois saisonniers suivis d'un Hexagonal disputé par les trois meilleurs clubs de chaque tournoi. Cependant, le système de promotion-relégation entre les tournois est maintenu.
C'est le Club Deportivo El Nacional, tenant du titre, qui est à nouveau sacré, après avoir terminé en tête de l'Hexagonal, avec deux points d'avance sur le Club Sport Emelec et trois sur le LDU Quito. C'est le 13e titre de champion d'Équateur de l'histoire du club.
Le barème de points utilisé pour déterminer les différents classements est le suivant :
- Victoire : 3 points
- Match nul : 1 point
- Défaite : 0 point
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Qualification pour l'Hexagonal et pour la Copa Sudamericana 2006
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Qualification pour l'Hexagonal
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Relégation directe en Série B
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T : Tenant du titre P : Promu de Série B
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- Les trois premiers reçoivent un bonus respectif de 3,2 et 1 point au démarrage de la Liguilla.
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Qualification pour l'Hexagonal et pour la Copa Sudamericana 2007
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Qualification pour l'Hexagonal
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Relégation directe en Série B
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T : Tenant du titre P : Promu de Série B
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- Les trois premiers reçoivent un bonus respectif de 3,2 et 1 point au démarrage de la Liguilla.
Un classement cumulé est établi en ajoutant les résultats obtenus lors des deux tournois; il permet de déterminer le sixième qualifié pour l'Hexagonal, le Club Deportivo El Nacional ayant terminé à deux reprises parmi les trois premiers. Seules les équipes ayant disputé les deux tournois sont classées.
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Qualification assurée pour l'Hexagonal
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Qualification pour l'Hexagonal par le biais du classement cumulé
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Relégation directe en Série B
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T : Tenant du titre
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