Caliciviridae
La famille des Caliciviridae appartient au groupe IV des virus à ARN simple brin (à polarité positive). Ils sont retrouvés chez un grand nombre d'organismes tels que l'être humain, les primates, le chat, le porc, le poulet, les reptiles, les dauphins, et les amphibiens.
| Realm | Riboviria |
|---|---|
| Règne | Orthornavirae |
| Embranchement | Pisuviricota |
| Classe | Pisoniviricetes |
| Ordre | Picornavirales |
Genres de rang inférieur
Les calicivirus ont été peu étudiés du fait des difficultés de leur culture et qu'il n'existe pas de modèle animal convenable. Les avancées en biologie moléculaire ont permis l'étude de son génome.
Le nom de calicivirus vient du mot latin calyx qui signifie « calice », la surface de certains virus présentant, en microscopie électronique, des dépressions en forme de calices.
Structure
modifierCe sont des virus non enveloppés, icosaédriques, mesurant 35 à 39 nm. Leur génome est de type ARN simple brin et code des protéines structurales (capside) et non structurales (polymérase, protéase).
Genres
modifierLes Caliciviridae sont divisés en 4 genres :
- le genre Vesivirus, qui n’infecte que l’animal,
- le genre Lagovirus, qui n’infecte que l’animal,
- le genre Norovirus ou Norwalk-Like Virus (NLV), dont l'exemple est le virus de Norwalk,
- et le genre Sapovirus ou Sapporo-Like Virus (SLV), qui infectent l’homme.
Pathogénécité
modifierLeur transmission est féco-orale, soit par contact inter-humain, soit par ingestion d’un aliment contaminé. L’hypothèse d’une transmission par voie aérienne a aussi été avancée.
Les Calcivirus ont un tropisme entérique et affectent les entérocytes matures.
La durée d'excrétion virale est de trois jours. La concentration virale par gramme de selles est supérieure à 10⁶.
Pathologies
modifierLes pathologies liées à cette famille de virus peuvent toucher la peau, ils peuvent être responsables de pneumonie, d'avortement, d'encéphalite, de myocardite, d'hépatites, de troubles de la coagulation.
Chez l'homme, ils sont fréquemment à l’origine d’épidémies de gastro-entérite, particulièrement ceux du genre NLV. La période d'incubation est de 12 à 24 heures ; la durée des signes cliniques, de 24 à 48 heures.
Méthodes de diagnostic
modifier- microscopie électronique,
- amplification des acides nucléiques par RT-PCR.
Références
modifier- (en) Cet article est partiellement ou en totalité issu de l’article de Wikipédia en anglais intitulé « Calciviridae » (voir la liste des auteurs).
Référence biologique
modifier- (en) Référence ICTV : Calciviridae (consulté le )
Bibliographie
modifier- Van der Poel W. Vinjé J. Van der Heide R. Herrera M.I. Vivo A. Koopmans M. Norwalk-Like Calicivirus genes in farm animals. Emerging Infectious Diseases 2000 ; 6 (1) : 36-41.
