Bernard Dujon
Bernard Dujon[1] (né le à Meudon (Hauts-de-Seine)) est un généticien français. Il est professeur émérite à Sorbonne Université et à l’Institut Pasteur[2] depuis 2015. Il est membre de l'Académie des sciences.
Naissance | |
---|---|
Nationalité | |
Formation |
Université Pierre-et-Marie-Curie (doctorat) ( - École normale supérieure (à partir de ) Université Pierre-et-Marie-Curie (doctorat) (jusqu'en ) |
Activités |
Membre de | |
---|---|
Distinction |
Formation et carrière
modifierAprès un baccalauréat Série Sciences expérimentales (1965), il est admis 1er au concours D, de l’École normale supérieure de la rue d'Ulm (1966).
Après une maîtrise de génétique à l'université Pierre-et-Marie-Curie, Paris (1968), il soutient un Diplôme d'études approfondies (DEA) de génétique approfondie, université Pierre-et-Marie-Curie, Paris (1969) puis un doctorat ès sciences naturelles, spécialité génétique, université Pierre-et-Marie-Curie, Paris, (1976).
Il fut élève fonctionnaire stagiaire à l’École normale supérieure de 1966 à 1970, puis stagiaire, attaché, chargé, puis maître de recherches au CNRS de 1970 à 1983.
Parmi ses fonctions occupées durant sa carrière, il convient également de noter :
- Professeur à l’université Pierre-et-Marie-Curie (1983-2015)
- Maître de conférence à temps partiel à l’École polytechnique (1984-1988)
- Chef de laboratoire (1989-1992), puis professeur à l’Institut Pasteur (1993-2015)[3]
- Membre senior de l’Institut universitaire de France (1997-2011)[4]
- Directeur général adjoint scientifique de l’Institut Pasteur (2006-2008).
Œuvre scientifique
modifierLes travaux scientifiques de Bernard Dujon portent sur le matériel génétique des organismes eucaryotes, son organisation, sa dynamique, son fonctionnement et son évolution. L'essentiel de ses travaux a été réalisé en utilisant les levures, en particulier la levure de boulangerie Saccharomyces cerevisiae, comme matériel expérimental. D’autres levures pathogènes pour l’homme ou importantes pour les biotechnologies ont également été étudiées.
Au début des années 1970, à l'aide de méthodes purement génétiques comme l'isolement de mutants et l'analyse des croisements, Bernard Dujon s'est d'abord attaché à décrire les premières règles de l'hérédité mitochondriale[5]. Ces règles ont montré leur intérêt dans les phénomènes d'hérédité mitochondriale chez l'homme et les pathologies associées. C'est en analysant le génome mitochondrial de levure que son attention s'est rapidement porté sur les introns ce qui devait l'amener quelques années plus tard et par des chemins complexes à la distinction entre introns de groupe I et de groupe II, à leur caractérisation et à la découverte des endonucléases introniques ou homing-endonucleases [6],[7],[8]. Les introns sont des éléments internes aux gènes qui jouent un grand rôle dans leur fonctionnement et leur évolution. Après transcription en ARN, les réactions d'épissage séparent les introns des séquences qui les flanquent, appelés exons, qui, elles, se réassocient pour former le produit final du gène. Tout cela ne fut découvert qu'à la fin des années 1970 grâce aux méthodes naissantes de l'ADN recombinant et à de très nombreux travaux. C'est une "anomalie" héréditaire repérée dans les croisements de levure qui devait conduire Bernard Dujon à découvrir que certains introns mitochondriaux codent des endonucléases spécifiques de très longues séquences d’ADN et qui sont responsables de la propagation rapide de ces introns dans les génomes, un phénomène appelé intron-homing[9],[10]. Aujourd’hui, on connaît plusieurs dizaines de homing-endonucleases site-spécifique qui, dans le prolongement des premiers essais de Bernard Dujon avec son endonucléase I-Sce I sur la levure, les plantes ou les cellules animales, ont fourni les premiers outils pour l’ingénierie des génomes in vivo[11],[12].
Au milieu des années 1980, les progrès des techniques de clonage et de séquençage de l'ADN permettaient d'envisager la cartographie et le séquençage de génomes entiers de taille rapidement croissante. C'est la levure Saccharomyces cerevisiae, organisme modèle de choix des généticiens en même temps qu'outil de biotechnologies, qui fut le premier organisme eucaryote entièrement séquencé grâce à une collaboration internationale initiée par la communauté européenne. Bernard Dujon a participé à cette entreprise dès ses débuts, coordonnant le séquençage et la cartographie de plusieurs chromosomes[13]. La séquence de la levure, publiée en 1996, ouvrait une ère nouvelle car on découvrait, dans un organisme modèle pourtant très étudié, un très grand nombre de gènes dont les fonctions restaient totalement inconnues et les séquences ne révélaient pas d'homologues[14],[15]. L'existence de ces "orphelins", qui reste une propriété de tous les génomes séquencés jusqu'à maintenant, associée à d'autres propriétés du génome de la levure, comme sa redondance élevée, sa compacité et l'efficacité de la recombinaison homologue, ont fait de cet organisme l'un des prototypes des recherches en “génomique fonctionnelle”.
À la fin des années 1990, l'accélération des méthodes de séquençage de l'ADN et les progrès des analyses in silico des génomes, conduisaient Bernard Dujon, avec la collaboration d'autres laboratoires français, à développer une “génomique évolutive” des génomes eucaryotes en comparant les génomes de plusieurs espèces de levures du groupe des Hémiascomycètes [16]. Contrairement à ce que suggèrent leurs similarités morphologiques, ces levures révèlent, au niveau de leurs génomes, de grandes distances évolutives entre elles[17],[18]. Leur comparaison permet d'élaborer des théories nouvelles sur les mécanismes moléculaires d’évolution des génomes eucaryotes qui, grâce à la puissance de la génétique chez S. cerevisiae, peuvent être directement soumises à l'expérimentation. En combinant l'analyse comparative des génomes dans un phylum évolutif déterminé, celui des Hémiascomycètes, avec les approches expérimentales permises par ces levures, Bernard Dujon s'est intéressé aux mécanismes qui gouvernent l'évolution des génomes eucaryotes, tels que la formation et la perte des gènes[19], les échanges génétiques horizontaux[20] et les mécanismes d’altérations massives des chromosomes résultant d’accidents de la réplication de l’ADN dans les cellules placées en conditions de stress[21].
Bernard Dujon est également l'auteur d'un livre de vulgarisation sur la génétique[22].
Honneurs et distinctions
modifierMembre de sociétés savantes
modifier- Membre de la Société française de génétique (vice-président)
- Membre de la Genetic Society of America (emeritus)
- Membre de l’EMBO (depuis 1988)
- Membre de l'Academia Europaea (depuis 2000)
- Membre de l'Académie des sciences (depuis 2002)[23]
- Membre de Faculty of 1000, (2011)[24]
- Membre de la National Academy of Inventors, États-Unis (2017)[25]
Prix
modifier- Lauréat du Concours général (1965)
- Prix Thérèse-Lebrasseur de la Fondation de France (1991)
- Prix René-et-Andrée-Duquesne (2009)
- Docteur honoris causa, université de Pérouse, Italie (2016)
Décorations
modifierRéférences
modifier- « Who's who »
- « Brève biographie »
- « Institut Pasteur »
- « Institut Universitaire de France »
- B. Dujon et al., « Mitochondrial Genetics. IX. A model for recombination and segregation of mitochondrial genomes in Saccharomyces cerevisiae », Genetics, (1974) 78, p. 415-437
- B. Dujon, « Sequence of the intron and flanking exons of the mitochondrial 21S rRNA gene of yeast strains having different alleles at the omega and RIB 1 loci », Cell, (1980) 20, p. 185-197
- A. Jacquier and B. Dujon, « An intron encoded protein is active in a gene conversion process that spreads an intron into a mitochondrial gene », Cell, (1985) 41, p. 383-394
- L. Colleaux et al., « Universal code equivalent of a yeast mitochondrial intron reading frame is expressed into E. coli as a specific double strand endonuclease », Cell, (1986) 44, p. 521-533
- L. Colleaux et al., « Recognition and cleavage site of the intron encoded omega transposase », Proc. Natl. Acad. Sc. USA, (1988) 85, p. 6022-6026
- B. Dujon, « Group I introns as mobile genetic elements: facts and mechanistic speculations - a review », Gene, (1989) 82, p. 91-114
- A. Choulika et al., « Induction of homologous recombination in mammalian chromosomes by using the I-Sce I system of Saccharomyces cerevisiae », Mol. Cell. Biol, (1995) 15, p. 1968-1973
- A. Thierry and B. Dujon, « Nested chromosomal fragmentation in yeast using the meganuclease I-Sce I: a new method for physical mapping of eukaryotic genomes », Nuc. Acids Res., (1992) 20, p. 5625-5631
- B. Dujon et al., « Complete DNA sequence of yeast chromosome XI. », Nature, (1994) 369, p. 371-378
- A. Goffeau et al., « Life with 6000 genes », Science, (1996) 274, p. 546-567
- B. Dujon, « The yeast genome project: what did we learn ? », Trends in Genetics, (1996) 12, p. 263-270
- B. Dujon et al., « Genome Evolution in Yeasts », Nature, (2004) 430, p. 35-44 + suppl. mat.
- B. Dujon, « Yeast evolutionary genomics », Nature Rev. Genetics, (2010) 11, p. 512-524
- B. Dujon and E. Louis, « Genome diversity and evolution in the budding yeasts (Saccharomycotina) », Genetics, (2017) 206, p. 717-750
- M. Richetti et al., « Mitochondrial DNA repairs double strand breaks in yeast chromosomes », Nature, (1999) 402, p. 96-100
- L. Morales and B. Dujon, « Evolutionary Role of Interspecies Hybridization and Genetic Exchanges in Yeasts. », Microbiol. Mol. Biol. Reviews, (2012) 76, p. 721-739 + suppl. mat.
- A. Thierry et al., « Macrotene chromosomes provide insights to a new mechanism of high-order gene amplification in eukaryotes », Nature Comm., (2015) 6, p. 6154 + suppl. mat.
- Bernard Dujon (trad. Traduit en coréen en 2012), Comment évoluent nos gènes ?, Paris, Éditions Le Pommier, , 184 p. (ISBN 2-7465-0178-3 et 978-2-7465-0178-2)
- « Académie des sciences »
- « Faculty of 1000 »
- « National Academy of Inventors »
Liens externes
modifier
- Ressources relatives à la recherche :
- Entretien avec Bernard Dujon le 18 nov. 2019 (Histrecmed)